Die Leitung der Exekutivabteilung obliegt dem Geschäftsführer Stephen F. Dougherty. Direkt ihm unterstellt sind Susan Angulo, Stabschefin, James Sullivan, Chief Field Operations Officer, Paul Heck, Chief Administrative Officer, und Kevin Steet, Chief Financial Officer.

Zu den neun weiteren Abteilungen der SJTA gehören:

Die Flughafenbehörde beaufsichtigt sämtliche Abläufe am Atlantic City International Airport, darunter Flugplatzstandards und -verfahren, FAA-Vorschriften, Terminalsicherheit, Mieter- und Geschäftsmöglichkeiten für Fluggesellschaften sowie Wartung und Service für die 1.042.348 Passagiere, die den Flughafen im Jahr 2024 nutzten. Die Aufsicht über die Behörde liegt bei Flughafendirektor Timothy Kroll.

Die Abteilung Betriebswirtschaftslehre ist für die Unternehmensführung, das Personalwesen, das Außenwerbeprogramm für Plakatwände entlang des Atlantic City Expressway und die wirtschaftliche Entwicklung zuständig. Colleen Hackett, Direktorin der Betriebswirtschaftslehre, leitet die Abteilung.

Die Ingenieurabteilung ist für die Planung und den Bau von Großprojekten sowie Umweltschutzmaßnahmen auf dem Atlantic City Expressway und dem Atlantic City International Airport verantwortlich. Daniel Corrigan, technischer Direktor und Chefingenieur, leitet die Abteilung.

Die Betriebsabteilung ist für den Betrieb des Atlantic City Expressway verantwortlich. Dies umfasst (unter anderem) die Wartung und Instandhaltung der Fahrbahn, der Fahrgastinformationssysteme, des Fuhrparks, die Verwaltung der Staatspolizeieinsätze auf dem Expressway und der Emergency Service Patrol (ESP). Nelson W. Wiest, Betriebsleiter, leitet diese Abteilung.

Die Finanzabteilung ist für das Budget, das Investitionsprogramm, alle Buchhaltungs-, Einkaufs- und Treasury-Funktionen der Behörde sowie für die Gehaltsabrechnung und das Schuldenmanagement verantwortlich. Sie ist außerdem für die Leitung aller Finanztransaktionen der Behörde verantwortlich, wie z. B. die Ausgabe von Schuldtiteln, Refinanzierungen sowie langfristige und kurzfristige Investitionen. Kevin Steet, Finanzdirektor und Schatzmeister, leitet die Abteilung.

Die IT-Abteilung entwickelt, betreibt und wartet die Software, Hardware und Informationssysteme der SJTA. Dazu gehören alle Finanz- und Verwaltungsinformationssysteme, das Wide Area Network (WAN), das die Einrichtungen verbindet, sowie alle Software- und Hardwareprogramme und -prozesse. Joseph Mahoney, Direktor der IT, leitet die Abteilung.

Die Mautabteilung ist für die Verwaltung und Wartung des elektronischen Mauterhebungssystems der Behörde, den E-ZPass-Betrieb und die Einführung der vollelektronischen Maut zuständig. Die Abteilung kümmert sich auch um E-ZPass-Anliegen der Kunden, darunter Transponder, verpasste Mautgebühren und Verstöße. Karen Coughlin, Leiterin der Mautabteilung, leitet die Abteilung.

Die Kommunikationsabteilung informiert die Öffentlichkeit über Neuigkeiten der Behörde und kümmert sich um die gesamte Medienarbeit. Sie ist verantwortlich für die Entwicklung allgemeiner SJTA-Veranstaltungen, allgemeine Marketing- und Straßenwerbekampagnen. Sie betreut außerdem die Website und den Social-Media-Auftritt der Behörde, die Veröffentlichung öffentlicher Informationen, leitet OPRA-Anfragen an die zuständigen Stellen weiter und fördert die Öffentlichkeitsarbeit durch Veranstaltungen, Veröffentlichungen, Werbeaktionen, Outreach-Programme und die Öffentlichkeitsarbeit. David Zappariello, Kommunikationsdirektor, leitet die Abteilung.

Das Verkehrsministerium betreibt Linien, die die Erreichbarkeit von Arbeitsplätzen in Gebieten mit unzureichender Anbindung an den öffentlichen Nahverkehr verbessern sollen. Darüber hinaus bietet das Ministerium im Rahmen von Vereinbarungen mit mehreren Universitäten, Landkreisen und Unternehmen Shuttle-Dienste an. Als Beispiel für seine gemeinnützige Funktion unterstützt das Ministerium ein umfangreiches Programm zur Lieferung von Mahlzeiten nach Hause in Camden County. Der Betrieb wird durch Zuschüsse und Arbeitgeberbeiträge finanziert und bedient die Landkreise Atlantic, Camden und Gloucester. Dominic D'Amico, Direktor des Verkehrsministeriums, leitet das Ministerium.